P

python

It contains the simulator of the model DISTIGRI describe in the work https://link.springer.com/article/10.1007/s10530-023-03062-y

GenoFig is a tool for graphical vizualisation of annotated genetic regions, and homologous regions comparison. It was designed to be as easy to use as possible for biologists.

This repository contains the python code of the Marked-Release-Recapture simulator.

Interekt (INTERactive Exploration of Kinematics and Tropisms) is a user-friendly software for tracking and modeling plant motions.

Aide à la configuration et à l'alimentation en données d'un système d'information construit sur la norme OGC Sensorthings API.

Ce dépôt donne à voir les résultats de l'expérimentation menée de façon transversale entre les pôles SENS, ASTRA, Num4Sci pour l'identification et la classification automatique des publications appartenant au domaine des Sciences et Recherches Participatives.

Cette expérimentation avait pour but de tester les bénéfices potentiels de l'utilisation de modèles de langues, LLM, pour l'automatisation de la catégorisation de publications scientifiques.

Python package to download the tile table with urls of LIDAR-HD point cloud, DTM, DSM or DHM.

Contribution à la réalisation du "pilote" INRAE, dans le cadre du programme européen GraspOS

Gitlab Pages: https://egfv.pages-forge.inrae.fr/bioinfo/jbrowse-batch-submission

https://lindangulopez.streamlit.app/

SATLAND is an application to detect and characterize hotspots of change. It is based on Python libraries (xarray, Bfast, rasterio for back-end, Streamlit for Front-End)

Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"

XyDyS (Xylogenesis Dynamics Simulator) is a software for interactive exploration of computational models of wood formation.

Retranscription d'audio en txt

Développement d’une petite application Shiny et déploiement de celle-ci avec sk8, animé par Amandine Velt (SVQV) et Joseph Tran (EGFV) [AG CATI BARIC La Rochelle, 26-28/03/2024]

slides: https://baric.pages.mia.inra.fr/quarto-shiny-sk8

tutoriel: https://forgemia.inra.fr/baric/shiny-tutorial

Collection de scripts pour le dépouillement semi-automatique d'essais mécaniques réalisés au PIAF.