harvesting-aquifer

Implémentation sous Matlab d’un modèle thermodynamique de croissance de populations microbiennes (Desmond-Le Quémener et Bouchez 2014). Ce modèle se présente comme un système d’équations différentielles ordinaires, dont les variables sont les concentrations des réactifs chimiques dans le milieu réactionnel. Il s’agit d’un modèle cinétique permettant de simuler la compétition entre plusieurs guildes microbiennes. Le système sur lequel s’applique le modèle est un aquifère, modélisé comme un chemostat avec un nombre de compartiments variables. Les guildes microbiennes implémentées sont également variables et définies à la volée à partir de demi-équations accepteur/donneur d’électron (sur le modèle de celles définies par Jin et Bethke dans leur article de 2013).