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A fork of Deep learning VAE DeepSEM from https://github.com/HantaoShu/DeepSEM.git at 18/03/2024. The idea here is to change the code to be able to extract the models and make goodness of fit with predicted expression

Simulation tool to investigate the Consequences of Altered Recombination on the Efficiency of Breeding

Kernelized HAplotype-based MIXed model association mapping (KHAMIX)

Test Shiny package ecosystem for software engineering good practice. Use Schauberger et.al. 2021 dataset: Crop yields, area and production in France 1900-2018 (doi:10.5880/PIK.2021.001).

Rnem permet de simuler les dynamiques des interactions entre nématodes phytoparasites (nématodes à galles) et système racinaire des plantes. L'évolution de la virulence des nématodes face à des rotations de cultivars résistants et sensibles est une des applications principales.

Lien vers l'application : https://rnem.sk8.inrae.fr