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UTOPIA: an automatically UpdaTed, cOmPlete and consistent ITS reference dAtabase

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

Site web pour une école thématique interdisciplinaire Inrae

jvenn is a plug-in for the jQuery Javascript library. It is a flexible tool, based upon the venny tool first developed by J.C Oliveros (Oliveros, J.C (2007) VENNY, An integrative tool for comparing lists with Venn Diagrams).

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

A demo-genetic individual-based model for Atlantic salmon populations

A suite of C++ programs developed for transposable element search and their annotation in large eukaryotic genome sequence. A part of the REPET package.

https://mahendra-mariadassou.pages.mia.inra.fr/jc2bim2024/

Présentation en ligne sur GitLab Pages

Experimental data vizualization for FAANG.

Code storage Area of the RECORD Project packages.

Le projet s'inscrit dans le cadre d'un stage de fin d'étude encadré par Marie-Lise BENOT, Maya GONZALES et Olivier LEPAIS du projet ECUME de BIOGECO INRAe. L'étude se porte sur la corrélation entre diversité génétique et diversité spécifique des communautés végétales dunaires le long du cordon dunaire atlantique (du Nord de la Gironde au Sud des Landes)

Portabilité et mises en commun de workflows

RNAseq and EMseq analyses for the rosepigs project on stomach mucosa samples

R package. Retrieve French Hydrological Data from HydroPortail

OpenFLUID framework and applications

𝐂𝐀𝐖𝐄𝐓 (Calculation of Agronomical Water needs and EvapoTranspiration) is an open-source tool for automatic estimation of agricultural water needs

Project related to the development of a basket for RARe portal (https://urgi.versailles.inrae.fr/rare).