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A simple pipeline to assemble bacterial genomes from ONT sequencing

L'application diaphen-app permet de visualiser les données des capteurs du plateau Diaphen aux personnes qui en ont besoin. Que ce soit pour du pilotage ou pour de la consultation. L'application permet également de transférer les données des expérimentations sur la plateforme PHIS.

https://diaphen-app.sk8.inrae.fr

Public git repository for reproduction of analyses in Le Souchu et al. 2025 (https://doi.org/10.1101/2024.07.01.601558)

This repository contains the python code of the Marked-Release-Recapture simulator.

Build custom pystac extensions easily with pydantic

Bibliothèque cliente Java pour utiliser l'API issues de GitLab pour les demandes de support des applications AgroClim.

A few notebooks for users and developers, showing how to use STAC to manipulate geospatial data.

Communication materials