Explore projects

Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

panTEannot serially annotates transposable elements from multiple genomes using a common reference library. The annotation is a light version of TEannot from REPET package. These annotations can be used as input for the panREPET tool.

A set of functions to work with functional data (column-list) in data frame.

L'application permet, à partir de données de mortalité en élevage de volailles rentrées par l'utilisateur, de calculer les dates les plus probables de la première infection par un virus influenza aviaire hautement pathogène. L'application est basée sur un modèle épidémiologique classique de type SEIR, et l'estimation de la date de la première infection utilise un algorithme d'Approximate Bayesian Computation.

Lien d'accès à l'application https://first-inf.sk8.inrae.fr

Landscape Epidemiology and Evolution R package

Docs

CRAN

Shiny app || Shiny Multi app

Package for post-processing metaproteomics data

L'application fournit un accès direct aux valeurs extrêmes de charges de neige dans des conditions climatiques passées et futures en Europe, sur la base d'ensembles de données de réanalyses régionales et de projections climatiques régionales (CMIP5-EUROCORDEX) fournies par Copernicus. Il permet aux utilisateurs de visualiser les charges caractéristiques de neige (niveaux de retour 50 ans) en fonction de l'altitude et de la localisation.

https://snowload.sk8.inrae.fr