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DeFIS is a pipeline for archeo-ichtyologists and biologists allowing the recognition of diadromous fishes with ancient DNA sample based metrics method (such as Kmers ratio and Jaccard index) between references sequences and the samples.

PatHways lOngitudianal and diffErential aNanlysis in metabolomICS (PHOENICS). Perform differential analysis of metabolic pathways based on longitudinal metabolomics data.

BioMa Component of Maize Leaf Area Index in Sirius Quality

Connecteur entre dataverse et jupyterhub

A small project to set up a filtered search bar like in Gitlab (pipelines page)

basis for development of interactive population dynamics web applications

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

Example GitBook site using GitLab Pages: https://pages.gitlab.io/gitbook

Dépôt du site internet de la plateforme Genotoul-biostat

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

Un outil d’aide à la décision (indicateurs, analyses des indicateurs) pour une meilleure gestion des risques associés aux ongulés sauvages, plus particulièrement les dégâts causés par les ongulés sauvages sur la régénération forestière. Collaboration avec l’OFB pour répondre à un besoin des gestionnaires et des décideurs, mais également en réponse à la fiche d’action 4.3 issue des assises de la forêt et du bois.

https://barometre-national-foret-ongules.sk8.inrae.fr